جاءت فكرة إنشاء المجلس الإسلامي العالمي للدعوة والإغاثة ، خلال المؤتمر الحادي عشر لمجمع البحوث الإسلامية بالقاهرة عام 1988 م، تحت رعاية فخامة الرئيس / محمد حسني مبارك حيث جاء في كلمته إلى الإجتماع.
" ان الدعوة الإسلامية مطالبة بأن تتجه في جزء أساسي من نشاطها إلى خارج العالم الإسلامي ، وذلك لتعريف ذلك العالم الخارجي بالإسلام الصحيح وقيمه وتعاليمه الرفيعة وحضارته الإنسانية السامية – وإن ما يجب أن تقوم عليه الدعوة وما يجب أن تقوم به -هو الإعداد الصحيح لمن يتولون أمرها وينشرون رسالتها ويتخصصون فيها "
" ومن هنا ، أرى أن مؤتمركم هذا له رسالته الكبرى في هذه الفترة ، وأنا واثق من أنكم أهل لتحمل الرسالة وأدائها ، بما جمعكم من هدف كريم ، وبما تأخذون به انفسكم من تفان في سبيل أداء رسالتكم "
وقد عرض فضيلة الأمام الأكبر الشيخ / جاد الحق علي جاد الحق – شيخ الأزهر الشريف – رحمه الله – فكرة إنشاء المجلس وحددها ، وفي كلمته إلى المؤتمر ، حيث أشار إلى ضرورة تطوير أساليب الدعوة التي " لم تعد خطبه تلقى ، أو سورة من القرآن تتلى ، أو درسا دينيا يذاع ، أو كتبا تنشر ، وإنما تطورت وسائلها ومسائلها وإزدحمت الساحه بالدعاة والأدعياء ، وصار على العلماء – خاصة وسائر المسلمين حكاما ومحكومين عامة أن ينزلوا عند حكم الله في قوله "وأمرهم شورى بينهم"
وبذلك بلور فضيلة الأمام الأكبر فضيلة الشيخ / جاد الحق علي جاد الحق ( رحمه الله ) فكرة المجلس الإسلامي العالمي للدعوة والإغاثة ، أمام جميع المشاركين في المؤتمر الحادي عشر لمجمع البحوث الإسلامية ، الذي كان يضم عددا من رؤساء المنظمات الإسلامية العالمية العاملة في مجالي الدعوة والإغاثة .
بل حدد اهدافه في التنسيق والتعاون والتكامل ، وفي الإهتمام بقضية المسجد الأقصى ، والقضايا المعاصرة للأمة الإسلامية .
وعليه أصدر المؤتمر قرارا بضرورة تشكيل مجلس تنسيقي ، يضم المنظمات والمؤسسات التي تعمل في مجال الدعوة والإغاثة ، والتي يمتد نشاطها خارج حدود دولة المقر – وقد حدد القرار إختصاصات المجلس في التخطيط والتنسيق والتعاون والمتابعة – ويتكون في ثلاث إدارات فرعية متخصصة هي :
إدارة الإغاثة : وتضم الجهات العاملة في مجال الإغاثة .
إدارة إعداد وتدريب الدعاة : وتضم الجهات العاملة في هذا النوع من التعليم والتدريب .
ادارة التمويل: وتضم الجهات العاملة في تمويل الدعوة والإغاثة .
على أن يتولى الأزهر الشريف بالتعاون مع رابطة العالم الإسلامي بمكة المكرمة والهيئة الخيرية الإسلامية العالمية بالكويت الدعوة لإجتماع تأسيسي لصياغة النظام الأساسي واللوائح التنظيمية لهذا المجلس وفروعه .